Zasadę działania odpylacza workowego można podzielić na trzy główne etapy: filtrację, czyszczenie i odprowadzanie pyłu.
1. Etap filtracji: gdy-zapylony gaz przedostanie się do odpylacza przez wlot, duże cząstki pyłu najpierw osadzają się w pojemniku na kurz ze względu na zmniejszoną prędkość przepływu powietrza i działanie płyt prowadzących. Drobne cząsteczki kurzu unoszą się wraz z przepływem powietrza i podczas przechodzenia przez nie zatrzymują się na powierzchni worków filtracyjnych. Oczyszczony gaz jest odprowadzany z wnętrza worków filtracyjnych i przez wylot przedostaje się do atmosfery.
2. Etap czyszczenia: W miarę gromadzenia się kurzu na powierzchni worków filtrujących, przepuszczalność powietrza przez worki filtracyjne stopniowo maleje i wzrasta opór odpylacza. Gdy opór osiągnie ustawioną wartość, następuje aktywacja systemu czyszczenia. Biorąc za przykład czyszczenie strumieniem impulsowym, sprężone powietrze jest natychmiast wtryskiwane do wnętrza worków filtracyjnych przez rurę strumieniową, powodując szybkie rozszerzanie się worków filtracyjnych. Warstwa pyłu odpada pod wpływem bezwładności i opada do pojemnika na kurz.
3. Etap usuwania pyłu: Opadły pył jest usuwany przez urządzenie odprowadzające pył znajdujące się na dnie pojemnika na kurz, które może być obsługiwane ręcznie lub automatycznie. Aby zapewnić normalne działanie odpylacza, należy dostosować częstotliwość usuwania popiołu w zależności od stopnia gromadzenia się pyłu.